Phòng thí nghiệm kỹ thuật môi trường là nơi thực hành thí nghiệm cho các môn học của ngành Kỹ thuật môi trường ở bậc đại học và sau đại học. Đây cũng là nơi các sinh viên và học viên của khoa thực hiện các đồ án tốt nghiệp, luận văn cao học và luận án tiến sỹ. Bên cạnh đó phòng thí nghiệm còn phục vụ cho công tác nghiên cứu khoa học của cán bộ giảng viên và sinh viên trong khoa.